FileZilla Client で日本語ファイル名のファイルをアップロードすると、
ファイル名が文字化けして、ファイルの削除ができなくなる。

上部メニュー
「ファイル」
↓
「サイトマネージャ」
↓
「サイトマネージャ」画面
「文字セット」タブ
↓
「文字セット」タブ
「カスタム文字セットを使用」を選択
エンコーディングに「shift_JIS」を入力
↓
「接続」ボタン
↓
文字化けが直る。
ファイルの削除ができる。

削除後は、
「文字セット」タブ
「自動検出」に戻す。

(FileZilla Client バージョン 3.24.0)
(2017/12現在)